مركز تحقیقات كشاورزی استان مركزی بر اساس طرح جامع تحقیقات کشور در سال 1362 رسماً با گرایش‌های كاری خاك و آب، اصلاح و تهیه نهال و بذر و گیاه‌پزشکی موجودیت یافت و مرکز تحقیقات منابع طبیعی و امور دام استان مرکزی  نیز با بخش‌های تخصصی دام‌پروری، دامپزشكی، منابع طبیعی، آبخیزداری و اقتصادی و اجتماعی در سال 1371 تاسیس شد. پس از ادغام وزارتخانه های کشاورزی و جهاد سازندگی در سال 1382 این دو مرکز با هم ادغام شدند و با عنوان مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان مرکزی به فعالیت ادامه دادند. در سال 1394 با ادغام مراکز آموزش جهاد کشاورزی استانها، این مرکز با نام مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان مرکزی فعالیت می نماید.

مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان مرکزی بزرگترین مرکز پژوهشی در حوزه تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی در استان مرکزی با ساختار تشکیلاتی 3 معاونت پژوهش و فناوری، آموزشی و مدیریت منابع و 2 پردیس تحقیقاتی و آموزشی لوبیای خمین و انار ساوه‌، 5 ایستگاه تحقیقاتی (ایستگاه تحقیقات کشاورزی اراک، ایستگاه تحقیقات منابع طبیعی خسبیجان، پایگاه تحقیقات گیاهان دارویی اراک، پایگاه تحقیقات آبخوانداری خشکرود زرندیه، پایگاه تحقیقات علوم دامی فدک) ، 9آزمایشگاه تخصصی (آزمایشگاه خاک و آب، آزمایشگاه زراعی و باغی، آزمایشگاه گیاهپزشکی، آزمایشگاه ثبت و گواهی بذر، آزمایشگاه علوم دامی، آزمایشگاه آموزشی میکروبیولوژی، آزمایشگاه علوم پایه، آزمایشگاه جنگل و مرتع (هرباریوم با 1380 گونه گیاهی)،  آزمایشگاه کشت بافت) ، 7 کلکسیون بزرگ در سطح کشور شامل (انار، لوبیا، گل محمدی (46 ژنوتیپ)،گیاهان دارویی (بیش از 100گونه)، آویشن (76 اکسشن)، صنوبر، پسته وحشی) می‌باشد و همچنین با داشتن 34 پژوهشگر هیات علمی و کارشناس پژوهشی و اجرای سالیانه بیش از 80 پروژه تحقیقاتی، نقش برجسته ای در توسعه کشاورزی و منابع طبیعی استان مرکزی در راستای اهداف اقتصاد مقاومتی، اسناد بالا دستی، امنیت غذایی و نیازهای بخش کشاورزی و بهره وری در نهاده های کشاورزی ایفا می‌نماید.